Naslov (srp)

Analiza genoma odabranih fitopatogenih sojeva Pseudomonas syringae pv. aptata i njihova biološka kontrola posredovana Tip VI sekretornim sistemom Pseudomonas putida : doktorska disertacija

Autor

Ranković, Tamara, 1993-

Doprinosi

Stanković, Slaviša, 1965-
Lozo, Jelena, 1974-
Krstić Ristivojević, Maja, 1985-
Nikolić, Ivan S., 1987-
Medić, Olja, 1991-
Berić, Tanja, 1974-

Opis (srp)

Ovaj rad predstavlja prvu studiju koja se bavi detaljnom analizom genoma i sekretoma fitopatogenaPseudomonas syringae pv. aptata i njihove biokontrole posredstvom Tip VI sekretornog sistema(T6SS) prirodnih izolata Pseudomonas putida. Posebnim osvrtom na analizu faktora virulencije P.syringae pv. aptata, pokazane su razlike u repertoaru gena za efektore Tip III sekretornog sistema(T3SS) između izrazito virulentnog soja P21 u odnosu na slabo virulentni P16. U genomu P21identifikovani su geni za efektore AvrRpm1, HopAW1 i HopAU1 koji do sada nisu detektovani u P.syringae pv. aptata. Gajenjem P. syringae pv. aptata u uslovima koji imitiraju uslove u biljnomapoplastu uočeno je formiranje pila i pojačana sekrecija T3SS proteina. Većinom su efektorisekretovani u velikim količinama kod slabo virulentnih sojeva, dok su kod umereno i jako virulentnihprisutni u manjoj meri. P. putida S2/27 predstavlja jednog od najboljih kandidata za biološku kontroluP21, inhibirajući rast patogena na kontakt-zavisan način. Za inhibiciju su potencijalno zaslužni i drugimehanizmi pored T6SS. U odnosu na S2/27, gajenje u ko-kulturi sa P21 rezultuje smanjenomekspresijom hcp1 gena, indikatora aktivnosti T6SS. U in planta testovima pokazano je da folijarnainokulacija ili tretman rizosfere suspenzijom P. putida S2/27 značajno utiče na redukciju simptomaizazvanih P21 na šećernoj repi. T6SS utiče na povećanu ekspresiju npr1 i nced gena uključenih ulokalni imunski odgovor biljke, dok pri sistemskom odgovoru ne dolazi do povećane ekspresijepomenutih gena. Dobijeni rezultati ukazuju da je patogeni potencijal P. syringae pv. aptata uslovljendiverzitetom gena i sekretovanih efektora uključenih u virulenciju. P. putida S2/27 posedujepotencijal za primenu u njihovoj biološkoj kontroli.

Opis (srp)

Biologija - Biologija mikroorganizama / Biology- Biology of microorganisms Datum odbrane: 25.04.2025.

Opis (eng)

This study represents the first in-depth analysis of the genomes and secretomes of phytopathogenicPseudomonas syringae pv. aptata and their biocontrol mediated by the Type VI secretion system(T6SS) of Pseudomonas putida. The main focus was an investigation of the virulence factors of P.syringae pv. aptata, revealing differences in the gene repertoire for the Type III secretion system(T3SS) effectors between the highly virulent strain P21 and the low-virulent strain P16. In the P21genome we found genes for AvrRpm1, HopAW1, and HopAU1 effectors, which had not previouslybeen detected in P. syringae pv. aptata. After incubation of P. syringae pv. aptata in apoplast-likeconditions, the formation of pili and increased secretion of T3SS proteins were observed. Mainly, theT3SS effectors were highly secreted by the low-virulent strains, contrary to moderate and highlyvirulent strains. Among P. putida isolates, S2/27 represents one of the most promising candidates forbiocontrol of P21 in a contact-dependent manner. Potentially, other mechanisms besides T6SS areinvolved in the observed inhibition. Compared to S2/27, incubation in co-culture with P21 led todownregulating the hcp1 gene, which is the indicator of T6SS activity. In planta, foliar or rhizospheretreatment with P. putida S2/27 suspension resulted in the reduction of symptoms caused by P21 onsugar beet. T6SS led to the upregulation of npr1 and nced genes in plants' local immune response.This upregulation wasn’t observed in plants' systemic immune response. Overall, the pathogenicpotential of P. syringae pv. aptata is mediated by the diversity of genes and secreted effectorsinvolved in virulence. P. putida S2/27 has the potential for application in its biocontrol

Jezik

srpski

Datum

2025

Licenca

Ovo delo je licencirano pod uslovima licence
Creative Commons CC BY-NC-ND 3.0 AT - Creative Commons Autorstvo - Nekomercijalno - Bez prerada 3.0 Austria License.

http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/at/legalcode

Predmet

OSNO - Opšta sistematizacija naučnih oblasti, Mikrobiologija. Bakteriologija

Pseudomonas syringae pv. aptata, genom, sekretom, T3SS, Pseudomonas putida, biološka kontrola, T6SS

579.25:579.64(043.3)

OSNO - Opšta sistematizacija naučnih oblasti, Mikrobiologija. Bakteriologija

Pseudomonas syringae pv. aptata, genome, secretome, T3SS, Pseudomonas putida, biological control, T6SS