Naslov (srp)

Izolacija i karakterizacija sojeva Yersinia enterocolitica kod svinja na liniji klanja : doktorska disertacija

Autor

Arsić, Miloš, 1990-

Doprinosi

Petrović, Miloš, 1972-
Karabasil, Neđeljko, 1971-
Dmitrić, Marko, 1987-
Dimitrijević, Mirjana, 1969-
Šarić, Ljubiša, 1979-

Opis (srp)

Cilj istraživanja u okviru ove doktorske disertacije bio je utvrđivanje ukupne prevalencije Y. enterocolitica kod svinja i karakterizacija izolata u odnosu na bioserotip, prisustvo gena virulencije, genetski diverzitet i otpornost na antimikrobne lekove. Proučavani su mogući faktori rizika u proizvodnji svinja povezani sa infekcijom Y. enterocolitica koji nastaju u fazama pre klanja i za vreme klanja. Tokom četiri sezone pregledano je ukupno 960 uzoraka tonzila svinja poreklom sa farmi otvorenog i zatvorenog tipa zaklanih na tri različite klanice. Svinje su bile poreklom sa ukupno 30 različitih farmi raspoređenih u pet regiona u Republici Srbiji. Prilikom svakog uzorkovanja popunjavan je upitnik o uslovima na farmi kao i uslovima u toku transporta i vremenu boravka u depou klanice. Ukupna prevalencija Y. enterocolitica kod svinja iznosila je 10,4%. Najčešći bioserotip Y. enterocolitica bio je BT4/O:3 (81,6%). Patogenost 63 izolata Y. enterocolitica BT4/O:3 (uključujući i BT4 S-/O:3), potvrđena je prisustvom gena virulencije ail i ystA i odsustvom gena ystB (100%). Karakterizacijom 63 potvrđena izolata pomoću PFGE identifikovano je pet različitih genotipova sa zajedničkim identičnim genetskim profilima (100% sličnosti) unutar svakog genotipa. Četiri genotipa potiču sa oba tipa farmi i sa tri različite klanice, što ukazuje na visoku genetsku stabilnost i prostornu cirkulaciju patogenog mikroorganizma. Disk difuzionom metodom utvrđeno je da su svi izolati Y. enterocolitica bili su osetljivi na cefotaksim, ceftazidim, meropenem, gentamicin, trimetroprim i sulfonamide. Izolati koji potiču sa zatvorenog tipa farmi bili su rezistentni samo na ampicilin, dok je rezistencija na ampicilin, nalidiksinsku kiselinu, tetraciklin i hloramfenikol utvrđena na farmama otvorenog tipa. Metodom multivarijantne logističke regresije utvrđeni su faktori rizika koji zajedno doprinose pojavi infekcije svinja sa Y. enterocolitica i uključuju farme otvorenog tipa (odnos verovatnoće, OR=2,31, 95% interval poverenja, CI=1,41-3,79, p<0,001), vreme boravka u depou klanice od 3-6h (OR=1,63, CI=1,04-2,58, p<0,035) i zimsku sezonu (OR=3,85, CI=2,01-7,36, p<0,001). Pored opšte karakterizacije izolata Y. enterocolitica identifikacija glavnih rizika povezanih sa infekcijom omogućava bolju primenu preventivnih mera za smanjenje pojave i distribucije infekcije Y. enterocolitica.

Opis (srp)

Veterinarska medicina - Higijena i tehnologija mesa / Veterinary medicine - Meat hygiene and technology Datum odbrane: 17.07.2023.

Opis (eng)

The aim of the research within this doctoral dissertation was to determine prevalence of Y. enterocolitica in pigs of slaughter age and to characterize the isolates in relation to bio-serotype, the presence of virulence genes, genetic diversity, and antimicrobial resistance. Moreover, possible risk factors associated with Y. enterocolitica infection during the preharvested and harvested phase of pig production were studied. During four seasons, a total of 960 tonsil samples from pigs originating from farow to finish and fattening farms slaughtered at three different slaughterhouses were examined. The pigs came from a total of 30 different farms distributed in five regions in Serbia. During each sampling, a questionnaire was filled out about the conditions on the farm as well as the conditions during transport and the time of stay in the lairage. The overall Y. enterocolitica prevalence in the pigs was 10.4%. The most common Y. enterocolitica bioserotype was 4/O:3, accounting for 81.6% of investigated isolates. The pathogenicity of 63 Y. enterocolitica 4/O:3 (including 4S-/O:3) isolates, originating from all infected farms, was confirmed by the presence of both the ail and ystA virulence-associated genes and the absence of ystB gene (100%). Characterization with PFGE of 63 confirmed Y. enterocolitica isolates identified five different genotypes with shared identical genetic profiles (100% similarity) within each genotype. The four genotypes originate from both types of farms and from three different slaughterhouses, which indicates high genetic stability and spatial circulation of the pathogen. Using the disk diffusion method, it was determined that all isolates of Y. enterocolitica were susceptible to cefotaxime, ceftazidime, meropenem, gentamicin, trimethoprim and sulfonamides. Isolates originating from farrow-to-finish farms were only resistant to ampicillin, while resistance to nalidixic acid, tetracycline, and chloramphenicol at fattening farms was also observed. Using the method of multivariate logistic regression, risk factors that together affect Y. enterocolitica pig infection were determined and include fattening farms (odds ratio, OR=2.31, 95% CI=1.41–3.79, P<0.001), a 3–6 h lairage period (OR=1.63, 95% CI=1.04–2.58, P<0.035) and winter season (OR=3.85, 95% CI=2.01–7.36, P<0.001). In addition to the overall characterization of Y. enterocolitica isolates, identification of the main risks associated with infection allows better application of preventive measures to reduce the occurrence and distribution of Y. enterocolitica infection.

Jezik

srpski

Datum

2023

Licenca

Ovo delo je licencirano pod uslovima licence
Creative Commons CC BY-NC-ND 3.0 AT - Creative Commons Autorstvo - Nekomercijalno - Bez prerada 3.0 Austria License.

http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/at/legalcode

Predmet

OSNO - Opšta sistematizacija naučnih oblasti, Tehnologija animalnih namirnica

Yersinia enterocolitica, pigs, risk factors, bio-serotyping, PFGE, virulence genes, antimicrobial resistance

OSNO - Opšta sistematizacija naučnih oblasti, Tehnologija animalnih namirnica

Yersinia enterocolitica, svinja, faktori rizika, bio-serotipizacija, PFGE, geni virulencije, antimikrobna rezistencija

637.5.07:579.62(043.3)